Różnicowanie środowiskowych bakterii z rodzaju Aeromonas

• Autorzy: Sebastian Niestępski , Monika Harnisz , Ewa Korzeniewska , Adriana Osińska , Przemysław Kacprzyk

Warianty tytułu

Differentiation of Environmental Bacteria of Aeromonas

• Języki publikacji: PL

Abstrakty

Bakterie z rodzaju Aeromonas stanowią naturalną mikrobiotę wód powierzchniowych oraz gleb. Niektóre gatunki mogą wywoływać choroby u ryb, gadów oraz ssaków, w tym u ludzi. Skuteczna identyfikacja tych bakterii ze stawów hodowlanych czy wody pitnej może istotnie ograniczyć występowanie wywoływanych przez nie schorzeń. Celem niniejszej pracy było porównanie metod służących do identyfikacji bakterii z rodzaju Aeromonas izolowanych ze środowiska. Materiałem badawczym były szczepy środowiskowych Aeromonas sp., wyizolowane z rzeki Łyny (w Olsztynie) oraz ścieków oczyszczonych. Różnicowanie prowadzono, analizując materiał genetyczny izolatów za pomocą metody ERIC PCR rozszerzonej o występowanie genów oporności na tetracykliny oraz sekwencjonowania genu 16S rDNA. Wyniki niniejszych badań wykazały, że skuteczniejszą metodą do identyfikacji środowiskowych bakterii z rodzaju Aeromonas jest technika oparta na sekwencjonowaniu genu 16S rDNA(abstrakt oryginalny)

EN

Aeromonas spp. are natural microbiota of surface waters and soils. Some species can cause diseases of fish, reptiles and mammals, including humans. Effective identification of these bacteria isolated from ponds or drinking water can reduce the incidence of diseases caused by these bacteria. The aim of this study was to compare methods for identification of Aeromonas spp. Aeromonas spp. strains used in this study were isolated from the Lyna River (in Olsztyn) and treated wastewater (Olsztyn Municipal Wastewater Treatment Plant). The study was evaluated in two steps. In the first step the occurrence of repetitive ERIC sequences and tetracycline resistance genes was studied. In the second step the almost whole gene 16S rDNA was amplified and sequenced. DNA sequencing had higher discriminatory power and proved to be useful for the genetic analysis of Aeromonas spp. population, whereas of ERIC PCR to differentiate Aeromonas spp. was less(original abstract)

Słowa kluczowe

PL

Ekologia; Gospodarka wodna

EN

Ecology; Water management

• Czasopismo: Prace Naukowe Uniwersytetu Ekonomicznego we Wrocławiu
• Rocznik: 2016
• Numer: nr 461 Wybrane zagadnienia z bioekonomii
• Strony: 147--156

Twórcy

autor

Sebastian Niestępski

• Uniwersytet Warmińsko-Mazurski w Olsztynie

autor

Monika Harnisz

• Uniwersytet Warmińsko-Mazurski w Olsztynie

autor

Ewa Korzeniewska

• Uniwersytet Warmińsko-Mazurski w Olsztynie

autor

Adriana Osińska

• Uniwersytet Warmińsko-Mazurski w Olsztynie

autor

Przemysław Kacprzyk

• Uniwersytet Warmińsko-Mazurski w Olsztynie

Bibliografia

• Alavandi S.V., Ananthan S., 2003, Biochemical characteristics, serogroups, and virulence factors of Aeromonas species isolated from cases of diarrhoea and domestic water samples in Chennai, Indian Journal of Medical Microbiology, vol. 21, no 4, s. 233-238.
• Davin-Regli A., Bollet C., Chamorey E., Colonna D'Istria V., Cremieux A., 1998, A cluster of cases of infections due to Aeromonas hydrophila revealed by combined RAPD and ERIC-PCR, Journal of Medical Microbiology, vol. 47, s. 499-504.
• Francois B., Charles M., Courvalin P., 1997, Conjugative transfer of tet(S) between strains of Enterococcus faecalis is associated with the exchange of chromosomal DNA, Microbiology, vol. 143, s. 2145-2154.
• Gillan D., Speksnijder A., Zwart G., De Ridder C., 1998, Genetic diversity of the biofilm covering Montacuta ferruginosa (Mollusca, bivalvia) as evaluated by denaturing gradient gel electrophoresis analysis and cloning of PCR-amplified gene fragments coding for 16S rRNA, American Society for Microbiology, vol. 64, no 9, s. 3464-3472.
• Harnisz M., Korzeniewska E., Ciesielski S, Gołaś I., 2015, fet genes as indicators of changes in the water environment: Relationships between culture-dependent and culture-independent approaches, Science of the Total Environment, vol. 505, s. 704-711.
• Kozińska A., 2010, Bakteryjne choroby ryb hodowlanych - aktualne problemy, [w:] Szweda W., Siwicki A.K., Terech-Majewska E., 2010, Choroby ryb podlegające obowiązkowi zwalczania oraz inne choroby zagrażające hodowli - diagnostyka, profilaktyka, terapia, IRS, Olsztyn, s. 113-137.
• Kręgiel D., Rygała A., 2006, Ryzyko występowania w wodzie do picia bakterii z rodzajów Pseudomonas i Aeromonas, Przemysł Spożywczy, vol. 60, no 4, s. 46-49.
• Kręgiel D., Rygała A., 2010, Występowanie heterotroficznych bakterii z rodzaju Aeromonas w wybranym systemie dystrybucji wody, Ochrona Środowiska, vol. 32, no 4, s. 47-50.
• Martinez-Murcia A.J., Esteve C., Garay E., Collins M. D., 1992b, Aeromonas allosaccharophila sp. nov., a new mesophilic member of the genus Aeromonas, FEMS Microbiol. Lett., vol. 91, s. 199-206.
• Martinez-Murcia A.J., Benlloch S., Collins M.D., 1992a, Phylogenetic interrelationships of members of the genera Aeromonas and Plesiomonas as determined by 16S ribosomal DNA sequencing: lack of congruence with results of DNA-DNA hybridizations, Int. J. Syst. Bacteriol, vol. 42, s. 412-421.
• McMurry L.M., Park B.H., Burdett V., Levy S.B., 1987, Energy-dependent efflux mediated by class L (TetL) tetracycline resistance determinant from streptococci, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, vol. 31, s. 1641-1650.
• Nawaz M., Sung K., Khan S.A., Khan A.A., Steele R., 2006, Biochemical and molecular characterization of tetracycline-resistant aeromonas veronii Isolates from Catfish, Microbiology, vol. 72, s. 6461-6466.
• Nei M., Kumar S. (red.), 2000, Molecular Evolution and Phylogenetics, Oxford University Press, New York.
• Ng L.K., Martin I., Alfa M., Mulvey M., 2001, Multiplex PCR for the detection of tetracycline resistant genes, Mol. Cell Probe, vol. 15, no 4, s. 209-215.
• Nikolich M.P., Shoemaker N.B., Salyers, A.A., 1992, A Bacteroides tetracycline resistance gene represents a new class of ribosome protection tetracycline resistance, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, vol. 36, s. 1005-1012.
• Scott P.T., Rood J.I., 1989, Electroporation-mediated transformation of lysostaphin-treated Clostridium perfringens, Gene, vol. 82, s. 327-333.
• Sechi L.A., Deriu A., Falchi M.P, Fadda G., Zanetti S., 2002, Distribution of virulence genes in Aeromonas spp. isolated from Sardinian waters and from patients with diarrhea, Journal of Applied Microbiology, vol. 92, s. 221-227.
• Sharples G.J., Lloyd R.G., 1990, A novel repeated sequence located in the intergenic regions of bacterial chromosomes, Nucleic Acids Res., vol. 8, s. 6503-6508.
• Sneath P.H.A., Sokal R.R. (red), 1973, Numerical Taxonomy, Freeman, San Francisco.
• Speer B.S., Salyers A.A., 1988, Characterization of a novel tetracycline resistance that functions only in aerobically grown Escherichia coli, Journal of Bacteriology, vol. 170, s. 1423-1429.
• Tenover F.C., Leblanc D.J., Elvrum P., 1987, Characterization and expression of a cloned tetracycline resistance determinant from Campylobacter jejuni plasmid pUA466, Journal of Bacteriology, vol. 169, s. 2984-2989.
• Warsa U.C., Nonoyama M., Ida T., Okamoto R., Okubo T., Shimauchi C., Kuga A., Inoue M., 1996, Detection of tet(K) and tet(M) in staphylococcus aureus of Asian concountries by the polymerase chain reaction, Journal of Antibiotics, vol. 49, s. 1127-1132.
• World Health Organization (WHO), 2004, Guidelines for drinking water quality, Addendum Microbiological Agents in Drinking-wate, Geneva

Identyfikatory

DOI

10.15611/pn.2016.461.14